超聲波焊接雖然有許多優點，但也有一定的局限性。在超聲波焊接工藝的選擇和超聲波焊接塑料零件方案的實施之前，產品設計技術工程師必須認清超聲波焊接的局限性，并根據合理的零件方案，防止超聲波焊接缺陷的發生，提高焊接質量。
超聲波的動能很大，在整個焊接過程中，由于強度不足，容易導致塑性零件的破壞，也可能導致商品內部其它零件的破壞。因此，在產品設計的實施過程中，盡量提高塑料零件和其他零件在商品中的強度，或消除零件的焊接面積，在實施裝配線之前，盡可能地將超聲波焊接后的其它強度較低的零件進行分布。
由于原料的限制，超聲波焊接不能完全焊接塑料，這是超聲波焊接的一個很大的局限性。有的塑料具有良好的焊接性能，有的塑料的焊接性能較差，而超聲波焊接一般只適用于一種或類似塑料中間的焊接。如果兩個塑料零件的原材料是不同的，在大多數情況下，這與超聲波焊接捆綁沒有任何關系。因此，超聲波焊接工藝一旦被選擇，零件的原材料就不能隨意改變。曾經有一些技術工程師向小編輯展示，為什么ABS原材料的兩個塑料部分超聲波焊接，焊接質量很好，但由于其他程序，塑料部分的ABS原料為PBT，不能焊接？怪不得。
沒有拆卸；超聲波焊接不是拆卸連接，無法修復；一旦兩個零件根據超聲波焊接裝配成一個，如果發現產品質量問題，就不可能進行維修。
零件的尺寸和形狀有限；中小型塑料零件適合超聲波焊接，規格一般小于250×300 mm，大型零件可能需要幾種焊接工藝。超聲波焊接一般適用于形狀單一的塑料零件，復雜塑性零件的焊接質量可能較低。
